Відповідно до наказу МОЗ України від 21.09.2012 № 176-О «Про ліквідацію бюджетних закладів, установ та організацій, Що належать до сфери Управління Міністерства охорони здоров'я України» проводиться повна ліквідація санітарно-епідеміологічних
станцій в Україні. СЕС в Україні будуть повністю ліквідовані до 21 грудня 2012 року. Штат співробітників планується зменшити удвічі, а також скоротити кількість перевірок, але планується й підвищення штрафів за порушення.
Це не говорить про те, що на Україні СЕС не буде взагалі. На початку 2013 року СЕС повинні передати свої функції новій структурі - Державній санітарно-епідеміологічній службі. В областях з'являться дві нові структури: Державне
управління санепіднагляду, яке вже існує і набирається штат співробітників, і центри профілактичної медицини. Працівники управління отримають статус держслужбовців. А в центрах будуть проводити лабораторні дослідження. Дві
нові служби будуть виконувати всі функції колишніх санітарно-епідеміологічних. Мета даної ліквідації - створення більш ефективної системи контролю за Санепідситуацією в державі, не підконтрольною Міністерству охорони здоров’я.
Про наслідки реформування Держсанепідемслужби, здійснюваної в рамках адміністративної реформи, говорити дуже складно. Одним з основних моментів, на який слід звернути увагу - це те, що процес «реорганізації» має на увазі
повну ліквідацію СЕС, з перериванням трудових відносин з усіма співробітниками, відповідно до п. 1 ст. 40 КЗпП. Без роботи і з туманною перспективою залишаться близько 50 тисяч медиків, які вже попереджені про звільнення,
а в державі як мінімум місяць ніхто не контролюватиме санітарно-епідеміологічну ситуацію. На жаль, така «реорганізація» має всі шанси негативно вплинути на мешканців України: епідемії, інфекційні спалахи в дитячих садочках, школах,
неякісні продукти харчування на ринках, контроль за яким повинна нести СЕС, ніхто не відміняв. І головне питання: хто нестиме відповідальність під час «реорганізації» за ці речі - невідомо.